Důležitou součástí činnosti SSHMP je provozování skladu humanitárního materiálu. Původně měla SSHMP ve správě pouze prostředky, které by sloužily obyvatelstvu v případě povodní či jiných krizových situací. Pandemie onemocnění COVID-19 a poté příliv uprchlíků z Ukrajiny povýšily sklad v areálu SSHMP Kundratka na logistické centrum, které bylo hl. m. Prahou využíváno pro distribuci ochranných pomůcek spojených s pandemií COVID-19 a poté pro distribuci pomoci uprchlíkům z Ukrajiny. Pracovníci SSHMP převzali, vytřídili a poté distribuovali stovky tun humanitárního materiálu.
Každý den z areálu SSHMP Kundratka vyrážejí nejméně dvě velké dodávky s potravinami a dalšími základními potřebami pro uprchlíky v Krajském asistenčním centru pomoci Ukrajině a na jiných místech.
Zásobování humanitární pomocí SSHMP usnadňuje též nový sklad humanitárního materiálu, který byl dokončen a zkolaudován pro užívání na počátku roku 2022 krátce před vypuknutím konfliktu na Ukrajině.
Na příjem a třídění humanitární pomoci je také vyčleněna technika původně určená zejména na manipulaci s mobilními protipovodňovými opatřeními. Protipovodňový materiál ve skladech však zůstává i nadále: jsou zde například uloženy stovky lopat, košťat, kbelíků, holin či vysoušečů.
